Výber prúdového transformátora pre ochranné aplikácie sa líši od výberu transformátora pre meranie. Ochranné transformátory prúdu musia správne fungovať počas abnormálnych podmienok, najmä pri skratoch a zemných poruchách. Ich účelom nie je len presne merať prúd pri normálnej záťaži, ale reprodukovať poruchový prúd dostatočne verne, aby ochranné relé rýchlo detekovalo a odstraňovalo poruchy. To si vyžaduje pozornosť limitnému faktoru presnosti, zloženej chybe, napätiu v kolennom bode, tepelným hodnotám a dynamickej stabilite.
Prvým krokom je pochopenie schémy ochrany. Nadprúdová, diferenciálna, vzdialenostná, zemná-ochrana a ochrana transformátora kladú na CT rôzne požiadavky. Pre jednoduchú nadprúdovú ochranu môže postačovať CT triedy 5P alebo 10P. Pre diferenciálnu ochranu musia mať transformátory prúdu na všetkých stranách chránenej zóny zhodné charakteristiky, aby sa predišlo chybnému vypnutiu. Pre ochranu na diaľku je dôležitá fázová presnosť a prechodový výkon. Vždy by sa mali dodržiavať požiadavky výrobcu relé.
Limitný faktor presnosti, alebo ALF, udáva, koľkonásobok menovitého primárneho prúdu môže CT preniesť, pričom zostane v rámci svojej špecifikovanej zloženej chyby. CT s označením 5P10 má zloženú chybu 5 % až do 10-násobku menovitého prúdu. 5P20 CT dokáže udržať presnosť až 20-násobku menovitého prúdu. ALF musí byť dostatočne vysoké pre maximálny poruchový prúd v mieste inštalácie. Ak je hodnota ALF príliš nízka, CT sa môže počas poruchy nasýtiť a relé nemusí fungovať alebo môže pracovať príliš pomaly.
Napätie v kolennom bode je tiež dôležité, najmä pre vysoko{0}}impedančnú diferenciálnu ochranu a niektoré elektromechanické relé. Označuje bod, v ktorom sa jadro CT začína saturovať. Vyššie napätie v kolennom bode znamená, že CT môže reprodukovať väčšie poruchové prúdy bez skreslenia. Požadovaná hodnota závisí od zaťaženia relé, odporu vedenia a úrovne poruchového prúdu. Do výpočtu je potrebné zahrnúť odpor sekundárneho vinutia CT a pripojené zaťaženie.
Musia sa skontrolovať krátkodobé-hodnoty tepelného a dynamického prúdu. Tieto hodnotenia ukazujú, koľko poruchového prúdu môže CT vydržať počas stanoveného času bez poškodenia. Primárny vodič, izolácia a mechanická štruktúra musia prežiť tepelné a magnetické sily spôsobené skratom. Vysoko-prúdové systémy vyžadujú CT s robustnou konštrukciou a vysokým krátkodobým{5}}hodnotením.
Záťaž je ďalším kritickým faktorom. Ochranné CT musia napájať relé, vedenie a pomocné zariadenia. Ak celková záťaž presiahne hodnotenie CT, CT sa môže saturovať skôr, čím sa zníži spoľahlivosť ochrany. Dlhé sekundárne káble zvyšujú záťaž, takže môžu byť potrebné väčšie veľkosti vodičov alebo kratšie vedenia. Sekundárny okruh nesmie byť nikdy otvorený, kým tečie primárny prúd, pretože sa môže objaviť nebezpečné napätie.
Inštalácia a testovanie sú nevyhnutné. Musí sa overiť správna polarita, identifikácia fázy, uzemnenie a zapojenie. Primárne vstrekovacie testy alebo sekundárne vstrekovacie testy sa často používajú na potvrdenie pomeru, polarity a prevádzky relé. CT musí byť tiež kompatibilné s rozvádzačom, prípojnicou a podmienkami prostredia. Správne zvolené ochranné CT zostane presné počas porúch, bude správne koordinovať s relé a pomôže predchádzať poškodeniu zariadenia a bezpečnostným rizikám.